MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	TAG	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019679	T	6	6	60	65	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019679	AAGA	2	8	79	86	75 %	0 %	25 %	0 %	427740401
4	NC_019679	CGTTGT	2	12	110	121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427740401
5	NC_019679	TGT	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
6	NC_019679	TCT	2	6	265	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
7	NC_019679	TGTCG	2	10	345	354	0 %	40 %	40 %	20 %	427740401
8	NC_019679	CTA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
9	NC_019679	CTA	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
10	NC_019679	TTTG	2	8	416	423	0 %	75 %	25 %	0 %	427740401
11	NC_019679	GTT	2	6	450	455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
12	NC_019679	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
13	NC_019679	CCT	2	6	538	543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740401
14	NC_019679	ATC	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
15	NC_019679	GCC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427740401
16	NC_019679	ACC	3	9	642	650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740401
17	NC_019679	TTG	2	6	741	746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
18	NC_019679	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	427740401
19	NC_019679	CT	3	6	821	826	0 %	50 %	0 %	50 %	427740401
20	NC_019679	TGTT	2	8	886	893	0 %	75 %	25 %	0 %	427740402
21	NC_019679	A	6	6	980	985	100 %	0 %	0 %	0 %	427740402
22	NC_019679	CTT	3	9	1041	1049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
23	NC_019679	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740403
24	NC_019679	TGCG	2	8	1168	1175	0 %	25 %	50 %	25 %	427740403
25	NC_019679	CTT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
26	NC_019679	AATC	2	8	1274	1281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019679	TCC	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740404
28	NC_019679	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740404
29	NC_019679	TCT	2	6	1423	1428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740404
30	NC_019679	TATT	2	8	1444	1451	25 %	75 %	0 %	0 %	427740404
31	NC_019679	GTT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740405
32	NC_019679	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	427740405
33	NC_019679	ATTT	2	8	1588	1595	25 %	75 %	0 %	0 %	427740405
34	NC_019679	CAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019679	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019679	TAA	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019679	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019679	AGT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019679	ACT	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019679	GAA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740406
41	NC_019679	ACA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740407
42	NC_019679	AGC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740407
43	NC_019679	TGA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
44	NC_019679	TGA	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
45	NC_019679	AGA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740407
46	NC_019679	CCA	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019679	CA	3	6	2549	2554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019679	GGT	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019679	A	6	6	2659	2664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019679	AAT	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019679	TTC	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740408
52	NC_019679	ATGTAG	2	12	2745	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740408
53	NC_019679	GAA	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
54	NC_019679	CAT	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740408
55	NC_019679	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
56	NC_019679	TA	3	6	2918	2923	50 %	50 %	0 %	0 %	427740408
57	NC_019679	AAT	2	6	2950	2955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
58	NC_019679	TAA	2	6	2959	2964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
59	NC_019679	AAG	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
60	NC_019679	AGA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
61	NC_019679	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
62	NC_019679	AT	3	6	3014	3019	50 %	50 %	0 %	0 %	427740408
63	NC_019679	TAT	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740408
64	NC_019679	AAT	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
65	NC_019679	TGA	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740408
66	NC_019679	A	11	11	3088	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	427740408
67	NC_019679	AAAT	2	8	3119	3126	75 %	25 %	0 %	0 %	427740408
68	NC_019679	AT	3	6	3125	3130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019679	TAC	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019679	A	8	8	3187	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019679	TAC	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019679	T	6	6	3299	3304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019679	AAT	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019679	AT	3	6	3339	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	427740409
75	NC_019679	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
76	NC_019679	ATT	3	9	3438	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
77	NC_019679	A	6	6	3459	3464	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
78	NC_019679	TAG	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
79	NC_019679	AC	3	6	3655	3660	50 %	0 %	0 %	50 %	427740409
80	NC_019679	A	6	6	3665	3670	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
81	NC_019679	GTA	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
82	NC_019679	TAAAC	2	10	3698	3707	60 %	20 %	0 %	20 %	427740409
83	NC_019679	A	6	6	3708	3713	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
84	NC_019679	A	8	8	3728	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
85	NC_019679	TTAT	2	8	3740	3747	25 %	75 %	0 %	0 %	427740409
86	NC_019679	TAG	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
87	NC_019679	AGCTAC	2	12	3926	3937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427740409
88	NC_019679	AAT	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
89	NC_019679	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
90	NC_019679	TAA	2	6	4042	4047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
91	NC_019679	TGTAAA	2	12	4118	4129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	427740409
92	NC_019679	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740409
93	NC_019679	AAAAG	2	10	4162	4171	80 %	0 %	20 %	0 %	427740409
94	NC_019679	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
95	NC_019679	ATA	2	6	4194	4199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
96	NC_019679	CTGCCT	2	12	4236	4247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019679	TGG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019679	TGG	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019679	TAC	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019679	TGCC	2	8	4328	4335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019679	T	7	7	4356	4362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019679	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019679	T	6	6	4418	4423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019679	ATA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019679	T	6	6	4458	4463	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
106	NC_019679	T	8	8	4465	4472	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
107	NC_019679	GTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740410
108	NC_019679	TAC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740410
109	NC_019679	AAGT	2	8	4562	4569	50 %	25 %	25 %	0 %	427740410
110	NC_019679	TAT	2	6	4632	4637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019679	GGA	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019679	AGCGA	2	10	4691	4700	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019679	CAT	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019679	ATT	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019679	A	6	6	4808	4813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019679	T	6	6	4826	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019679	TAA	2	6	4897	4902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019679	GGA	2	6	4907	4912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019679	TA	3	6	4946	4951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019679	G	6	6	4968	4973	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019679	GGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019679	AC	3	6	5154	5159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019679	A	7	7	5167	5173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019679	A	6	6	5208	5213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019679	AT	3	6	5228	5233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019679	ATT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019679	AT	3	6	5274	5279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019679	ATAA	2	8	5307	5314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019679	TTTA	2	8	5373	5380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019679	TCAT	2	8	5403	5410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019679	AT	3	6	5409	5414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019679	TAA	2	6	5416	5421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019679	TCAT	2	8	5449	5456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019679	AT	3	6	5455	5460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019679	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019679	T	7	7	5515	5521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019679	TGT	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019679	GT	3	6	5529	5534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019679	TCC	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_019679	C	6	6	5715	5720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_019679	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019679	TCC	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019679	ATT	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019679	A	6	6	5857	5862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019679	T	6	6	5875	5880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_019679	GTT	2	6	11683	11688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740416
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